(根據藥監部門的通報、醫學研究文獻、專業網站的資料搜集、整理。未包括所有已知有毒副作用的中藥，重點放在有腎毒性、肝毒性和致癌性的中藥上。另外，大部分中藥的毒副作用因缺乏研究，至今不明。)
毒副作用與一般的副作用不同，是指用藥後能導致器官損害、機體功能障礙，產生新的疾病，甚至導致死亡。
含有馬兜鈴酸的藥材
馬兜鈴酸為腎毒素，能造成腎小管大量喪失，導致腎衰竭，是典型的「中草藥腎病」，病情嚴重者需要終身做血液透析或腎移植。馬兜鈴酸也是潛在的致癌物質，動物實驗表明，食用馬兜鈴酸會導致淋巴瘤、腎癌、肝癌、胃癌和肺癌等。
已知或懷疑含有馬兜鈴酸的藥材：馬兜鈴、關木通、天仙籐、青木香、廣防己、漢中防己、細辛、追風籐、尋骨風、淮通、硃砂蓮、三筒管、杜衡、管南香、南木香、籐香、背蛇生、假大薯、蝴蝶暗消、逼血雷、白金果欖、金耳環、烏金草等。
可能與上述藥材混用而攙雜馬兜鈴酸的藥材：木通、苦木通、紫木通、白木通、川木通、預知子、木防己、鐵線蓮、威靈仙、香防己、白英、白毛籐、大青木香等。
含有以上藥材的中成藥：龍膽瀉肝丸、耳聾丸、八正丸(散)、純陽正氣丸、大黃清胃丸、當歸四逆丸(湯)、導赤丸(散)、甘露消毒丹(丸)、排石顆粒、跌打丸、婦科分清丸、冠心蘇合丸、蘇合丸、辛荑丸、十香返生丸、濟生桔核丸、止嗽化痰丸、八正合劑、小兒金丹片(丸)、分清五淋丸、安陽精製膏、辛夷丸、兒童清肺丸、九味羌活丸(顆粒、口服液)、川節茶調丸(散)、小兒咳喘顆粒、小青龍合劑(顆粒)。
硃砂
主要成分為硫化汞，導致汞中毒，損害中樞神經、腎臟和消化道。
含硃砂的中成藥：一捻金、二十五味松石丸、二十五味珊瑚丸、十香返生丸、七珍丸(丹)、七厘散、萬氏牛黃清心丸、小兒百壽丸、小兒至寶丸、小兒金丹片、小兒驚風散、小兒清熱片、天王補心丸、牙痛一粒丸、牛黃千金散、牛黃抱龍丸、牛黃清心丸、牛黃鎮驚丸、安宮牛黃丸、安宮牛黃散、紅靈散、蘇合香丸、醫癇丸、補腎益腦片、局方至寶散、純陽正氣丸、抱龍丸、柏子養心丸、胃腸安丸、香蘇正胃丸、保赤散、益元散、梅花點舌丸、琥珀抱龍丸、紫金錠、紫雪、暑症片、舒肝丸、痧藥、避瘟散、人參再造丸、平肝舒絡丸、再造丸、復方蘆薈膠囊。
雄黃
主要成分為硫化砷，導致砷中毒，損傷神經、血管，並可引起肝、腎、脾及心肌等實質器官的脂肪變性、壞死和癌變。
含雄黃的中成藥：七珍丸、小兒化毒散、小兒至寶丸、小兒驚風散、小兒清熱片、牙痛一粒丸、牛黃至寶丸、牛黃抱龍丸、牛黃消炎片、牛黃清心丸、牛黃解毒丸(片)、牛黃鎮驚丸、六應丸、安宮牛黃丸(散)、紅靈散、醫癇丸、局方至寶散、阿魏化痞膏、純陽正氣丸、珠黃吹喉散、梅花點舌丸、紫金錠、暑症片、痧藥。
千里光
含有不飽和吡咯裡西啶類生物鹼，會對肝臟造成嚴重損害，並且是強致癌物質。也有腎毒性。
中成藥：千柏鼻炎片、感冒消炎片、千喜片。
柴胡
其主要成分柴胡皂甘能導致腎上腺肥大、胸腺萎縮，降低人體免疫功能。有腎毒性，能損害腎臟。
中成藥：小柴胡片、小柴胡顆粒、柴胡口服液、柴胡舒肝丸、小兒熱速清口服液、午時茶顆粒、牛黃清心丸、氣滯胃痛顆粒、龍膽瀉肝丸、加味逍遙丸、護肝片、補中益氣丸、乳疾靈顆粒、逍遙丸、消食退熱糖漿、通乳顆粒、黃連羊肝丸、得生丸、清瘟解毒丸、舒肝和胃丸、感冒清熱顆粒、鼻淵舒口服液、鼻竇炎口服液、平肝舒絡丸、安坤贊育丸。
板藍根
長期服用能損害腎臟，並能導致內出血和對造血功能造成損傷。
中成藥：板藍根顆粒、二丁顆粒、兒童清肺丸、小兒肺熱咳喘口服液、小兒熱速清口服液、小兒清熱止咳口服液、小兒感冒茶、小兒感冒顆粒、護肝片、利咽解毒顆粒、金嗓散結丸、復方魚腥草片、健民咽喉片、羚羊清肺丸、清開靈口服液、清熱解毒口服液、感冒退熱顆粒、清開靈注射液。
款冬
含致癌成分，能導致肝癌。
中成藥：川貝雪梨膏、止咳橘紅口服液、止嗽化痰丸、橘紅丸。
蜈蚣
主要含有組胺樣物質和溶血蛋白質兩種類似蜂毒酸的有毒成分。超量中毒有溶血作用，能引起過敏性休克，少量能興奮心肌，大量能使心肌麻痺，並能抑制呼吸中樞等。
中成藥：止痛化癥膠囊、中風回春丸、中風回春片、醫癇丸、金蒲膠囊、狼瘡丸、通心絡膠囊。
水蛭
含水蛭素，能阻止凝血酶的作用，引起內臟廣泛出血。有腎毒性，可導致腎臟損害。
中成藥：大黃蜇蟲丸、血栓心脈寧膠囊、通心絡膠囊、清腦降壓片、化癥回生片。
黄连、黄柏
含小檗碱(黄连素)，孕妇服用可导致新生儿溶血症，儿童服用可引起急性溶血、严重黄疸。
中成药：复方黄连素片、黄连上清丸、黄连羊肝丸、一清颗粒、万氏牛黄清心丸、万应胶囊、万应锭、小儿化毒散、小儿清热片、木香槟榔丸、五福化毒丸、牛黄上清丸、牛黄上清胶囊、牛黄千金散、左金丸、左金胶囊、石斛夜光丸、戊己丸、芎菊上清丸、当归龙荟丸、安宫牛黄丸(散)、导赤丸、妇科分清丸、芩连片、拨云退翳丸、参精止渴丸、驻车丸、枳实导滞丸、栀子金花丸、香连丸(片)、复方仙鹤草肠炎胶囊、桂龙咳喘宁胶囊、脏连丸、狼疮丸、消渴灵片、清胃黄连丸、葛根芩连丸、蛤蚧定喘丸、癃清片、人参再造丸、平肝舒络丸、再造丸、二妙丸、九圣散、三妙丸、大补阴丸、小儿肝炎颗粒、分清五淋丸、功劳去火片、生血丸、白带丸、如意金黄散、固经丸、知柏地黄丸、河车大造丸、健步丸、清肺抑火丸、颈复康颗粒、鼻炎片、三黄片。
麻黄
能导致高血压、心悸、神经损伤、肌病、中风、精神错乱、记忆力丧失，可致死。有肝毒性。
中成药：儿童清肺丸、九分散、千柏鼻炎片、小儿肺热咳喘口服液、小儿咳喘颗粒、小儿清热止咳口服液、小青龙合剂、小青龙颗粒、止喘灵注射液、止嗽定喘口服液、风湿马钱片、风湿骨痛胶囊、风寒咳嗽颗粒、防风通圣丸、宝咳宁颗粒、复方川贝精片、急支糖浆、洋参保肺丸、祛风舒筋丸、通宣理肺丸、清肺消炎丸、蛤蚧定喘丸、舒筋丸、痧药、疏风定痛丸、鼻炎片、镇咳宁糖浆、鹭鸶咯丸、人参再造丸、再造丸。
何首乌
能导致中毒性肝炎。
中成药：乙肝宁颗粒、七宝美髯颗粒、儿康宁糖浆、三宝胶囊、天麻首乌片、心通口服液、再造生血片、血脂宁丸、血脂灵片、产复康颗粒、安神补脑液、安神胶囊、更年安片、龟鹿补肾丸、养血生发胶囊、首乌丸、脂脉康胶囊、益气养血口服液、人参再造丸、平肝舒络丸、再造丸。
大黄
会干扰胆红素代谢途径，导致黄疸。能引起肝细胞退行性变化、前列腺上皮肥大或增生。
中成药：一捻金、一清颗粒、十一味能消丸、十香止痛丸、十滴水、十滴水软胶囊、八正合剂、三黄片、大黄清胃丸、大黄蜇虫丸、小儿化毒散、小儿化食丸、小儿热速清口服液、小儿清热片、木香槟榔丸、止痛紫金丸、止嗽化痰丸、牛黄上清丸、牛黄上清胶囊、牛黄至宝丸、牛黄消炎片、牛黄解毒丸(片)、分清五淋丸、六味安消散、当归龙荟丸、竹沥达痰丸、防风通圣丸、如意金黄散、妇科通经丸、利咽解毒颗粒、利胆排石片、金蒲胶囊、参精止渴丸(降糖丸)、导赤丸、枳实导滞丸、栀子金花丸、胃肠安丸、胆宁片、柴胡舒肝丸、脂脉康胶囊、狼疮丸、消食退热糖浆、黄氏响声丸、黄连上清丸、麻仁丸、麻仁润肠丸、痔康片、羚羊清肺丸、清宁丸、清肺抑火丸、清淋颗粒、跌打活血散、痧药、槟榔四消丸、礞石痰丸、蠲哮片、人参再造丸、化癥回生片、再造丸。
泽泻
能对实验动物的肝脏和肾脏造成损害。
中成药：七味都气丸、三宝胶囊、山菊降压片(山楂降压片)、五苓散、分清五淋丸、六味地黄丸、六味地黄颗粒、龙胆泻肝丸、归芍地黄丸、冯了性风湿跌打药酒、耳聋左慈丸、血脂灵片、麦味地黄丸、杞菊地黄丸、更年安片、启脾丸、补肾固齿丸、明目地黄丸、知柏地黄丸、金嗓散结丸、参茸固本片、枳实导滞丸、前列舒丸、济生肾气丸、桂附地黄丸、消栓通络片、消栓通络胶囊、锁阳固精丸、癃清片、安坤赞育丸。
益母草
长期使用对肾脏有毒。动物实验表明会刺激与怀孕有关的乳腺癌的增长。
中成药：八宝坤顺丸、女金丸、加味生化颗粒、再造生血片、产复康颗粒、参茸白凤丸、得生丸、痛经丸、化癥回生片。
延胡索
长期服用可损害心脏、肾脏。
中成药：九气拈痛丸、女金丸、元胡止痛片、止痛化癥胶囊、少腹逐瘀丸、气滞胃痛颗粒、仲景胃灵丸、伤痛宁片、壮骨伸筋胶囊、安中片、安胃片、妇宝颗粒、妇科十味片、妇科调经片、肠胃宁片、金蒲胶囊、参茸白凤丸、茴香橘核丸、胃康灵胶囊、胃舒宁颗粒、舒肝丸、猴头健胃灵胶囊、痛经丸、痛经宝颗粒、化癥回生片、平肝舒络丸、安坤赞育丸。
槟榔
含致癌物质水解槟榔碱。有肾毒性。
中成药：一捻金、九气拈痛丸、大黄清胃丸、山楂化滞丸、小儿至宝丸、开胸顺气丸、木香分气丸、木香槟榔丸、化积口服液、四正丸、利胆排石片、国公酒、金嗓利咽丸、肥儿丸、茴香橘核丸、柴胡舒肝丸、消食退热糖浆、消瘿丸、舒肝和胃丸、槟榔四消丸、蠲哮片。
厚朴
有肾毒性，可导致肾脏损害。
中成药：十香止痛丸、开胸顺气丸、木香分气丸、午时茶颗粒、六合定中丸、四正丸、冯了性风湿跌打药酒、如意金黄散、利胆排石片、抱龙丸、国公酒、金嗓利咽丸、胃肠安丸、香苏正胃丸、香砂养胃丸、保济丸、柴胡舒肝丸、消食退热糖浆、麻仁丸、清宁丸、舒肝丸、藿香正气口服液、藿香正气水、藿香正气软胶囊、平肝舒络丸。
胖大海
有肾毒性，可导致肾脏损害。
中成药：金果含片、健民咽喉片、黄氏响声丸、清喉利咽颗粒。
